Các nghiên cứu về moxidectin cho thấy tác dụng phụ khác nhau tùy theo động vật và có thể bị ảnh hưởng bởi công thức, phương pháp ứng dụng và liều lượng của sản phẩm.

Một quá liều moxidectin làm tăng tác dụng của axit gamma -aminobutyric (GABA) trong hệ thống thần kinh trung ương.[10] Trong ngựa, quá liều có thể dẫn đến trầm cảm, rủ cuûa möùc thaáp hôn môi, run, thiếu sự phối hợp khi di chuyển (mất điều hòa), tỷ lệ thở (giảm nhịp thở), sững sờ và hôn mê.[10]

Nếu một con chó liếm moxidectin từ da được áp dụng như một phương pháp điều trị "tại chỗ" (tại chỗ), điều này có tác dụng tương tự như quá liều, và có thể gây ra nôn mửa, chảy nước bọt và các dấu hiệu thần kinh như mất điều hòa, run rẩy và rung giật nhãn cầu.[6] Chó Collie không thể được dùng moxidectin.[6]